三池崇史根據1963版《十三刺客》(工藤榮一導演)改編的同名電影是一次成功的翻拍，相較於原版而言，新版《十三刺客》的故事邏輯更為縝密，動作快感更強，而且在忠實原著的基礎上，在細節部分進行了獨具匠心的改編。
總體說來，舊版《十三刺客》最為突出的就是片尾半個多小時的“殺陣戲”，這一特色在工藤榮一的時代劇三部曲(《大殺陣》《十三刺客》《十一武士》)中都有表現，新版《十三刺客》則對“殺陣戲”進一步強化，時間也從30分鐘延長到50分鐘左右，從開頭的埋伏戰、機關戰、到後來的刀劍搏殺和一對一決戰，層次豐富，鋪陳得當。原版由於技術問題，一些機關的細節設計不能得到完整的展現，戰鬥邏輯性也不是很強，但這些問題在新版中都得到完善。
舊版《十三刺客》的畫面強調垂直的線條和空間、環境的對稱性，在構圖上較為講究，新版也沿襲了這一特點(有些鏡頭的機位甚至一樣)，鏡頭的剪接更加頻繁，更加照顧了現代觀眾的欣賞習慣。
島田新左衛門(役所廣司飾)領命刺殺齊昭，新版增加了齊昭殘殺百姓後一位倖存者的慘狀，她的手腳全部被砍，舌頭也被割掉，她用嘴含著毛筆寫下了“全部被殺”的控訴狀，這一設計給予了島田新左衛門義無反顧地投身到刺殺行動的動機。而三池崇史對於鮮血和殺戮細致的描寫，在為電影貼上作者標簽的同時，也給新版《十三刺客》增加了些許邪典的意味。
舊版《十三刺客》還詳細描寫了攻守雙方針對形式鬥智的細節，但新版對於這一層面的描寫顯然少了許多，而把更多的篇幅給了動作戲。雖然《十三刺客》是成色十足的群戲，但舊版對於人物個性的描寫還是趨近於臉譜化，導演三池崇史為幾乎每一個人物都設計了起碼一場戲，讓他們的性格凸顯出來，雖然大戰前導演沒有展現這十三個人的群像，但片尾每一個死去的武士都有一個鏡頭特表現，讓觀眾記住了他們是如何悲壯地死去。
在結尾，《十三刺客》做了大膽的顛覆，山民木賀小彌太(伊勢谷友介飾)在脖子被捅一刀之後原樣無損地出現，然後選擇了回歸山林，與新六郎(山田孝之飾)選擇了截然不同的道路。而新六郎表達了想做山賊的意願後，終究沒有扔掉手中的刀，選擇了繼續做一名武士。在武士片日漸式微的今天，這樣的表達別有一番滋味。 |
