當西班牙人征服庫斯科後﹐為了要傳天主教﹐對於印卡的宗教和建築加以破壞。一五七零年在金庭院的上面蓋了一所聖托多明哥(Church of Santo Domingo)教堂﹐十年後完工﹐只保留了一部份金庭院的建築。在一九五零年庫斯科的大地震中﹐百分之七十的建築都被震壞﹐在一九六零年代﹐秘魯政府重建或修補成原來的狀態。今日所能看見金庭院是被包圍在教堂中或下面的殘餘建築﹐真是令人惋惜。也對這些入侵者利用船堅炮利的傳教手段﹐破壞文化感到無奈。
花車頭(Sacsayhuaman)
相傳印卡王帕查庫特設計規劃庫斯科城市為一美洲獅的形態﹐但是還沒建造獅頭時﹐他就去世了。兒子圖派(Tupac)繼續其父遺志﹐在庫斯科盆地建了一所巨石城﹐命名為Sacsayhuaman﹐在庫斯科的古語中是花車頭(Sacsa = festooned; uma =head)。也有人稱之為意揚的獵鷹(Satisfied Falcon)﹐因為獵鷹或禿鷹都代表天。這座巨石城在一五三六年時﹐曾為印卡人反抗西班牙人的根據地。
